Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms