Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms