Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CWU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms