Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms