Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma8Q9CWH6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms