Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms