Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms