Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms