Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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