Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PompQ9CQT5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms