Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms