Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms