Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms