Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms