Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rab5aQ9CQD1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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