Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms