Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519G04RikQ9CPT7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms