Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms