Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4Q99P72 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms