Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad54l2Q99NG0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rad54l2Q99NG0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad54l2Q99NG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms