Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubqln4Q99NB8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubqln4Q99NB8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubqln4Q99NB8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubqln4Q99NB8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ubqln4Q99NB8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ubqln4Q99NB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln4Q99NB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln4Q99NB8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ubqln4Q99NB8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ubqln4Q99NB8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubqln4Q99NB8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms