Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acss1Q99NB1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms