Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms