Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac9Q99N13 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms