Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fars2Q99M01 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fars2Q99M01 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms