Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms