Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lysmd3Q99LE3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lysmd3Q99LE3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms