Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms