Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdcbp2Q99JZ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdcbp2Q99JZ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms