Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Higd1bQ99JY6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms