Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms