Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf112Q96DY5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms