Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgs1Q923W1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgs1Q923W1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms