Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms