Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms