Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf4Q8VI88 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms