Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RttnQ8R4Y8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms