Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C9

Vmn1r28, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r28Q8R2C9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vmn1r28Q8R2C9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r28Q8R2C9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r28Q8R2C9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r28Q8R2C9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r28Q8R2C9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r28Q8R2C9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r28Q8R2C9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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