Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r200Q8R281 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r200Q8R281 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Vmn1r200Q8R281 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Vmn1r200Q8R281 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Vmn1r200Q8R281 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Vmn1r200Q8R281 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Vmn1r200Q8R281 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r200Q8R281 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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