Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
StradbQ8K4T3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms