Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colec12Q8K4Q8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms