Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Glis1Q8K1M4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Glis1Q8K1M4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms