Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit1Q8K099 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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