Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcerg1Q8CGF7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcerg1Q8CGF7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcerg1Q8CGF7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcerg1Q8CGF7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcerg1Q8CGF7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms