Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pramef8Q8CE24 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pramef8Q8CE24 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pramef8Q8CE24 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms