Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RybpQ8CCI5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms