Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf170Q8CBG9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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