Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms