Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4930507D05RikQ8C9C9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms