Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwc2Q8C8N3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms